Messa a punto di strategie molecolari per la comparazione di ceppi del batterio Xylella fastidiosa rinvenuti su olivo in Italia ed Argentina.
Development of molecular strategies for the comparison of Xylella fastidiosa strains from olive in Italy and Argentina
Ente finanziatore MAE
Progetto di Grande Rilevanza Italia - Argentina
Unità di Ricerca DAFNE UNITUS
Responsabile scientifico Dr. A. Mazzaglia, PhyDia srl
Partecipanti: Prof. Balestra G.M.
Durata 3 anni – 2018 - 2020
Abstract
Xylella fastidiosa sottospecie pauca agente causale del Complesso del Disseccamento rapido dell'olivo (CoDiRO) è tra le più gravi emergenze fitopatologiche oggi in atto. In Italia, nella regione Puglia, dalla prima segnalazione del 2013 risultano attaccati più di 200.000 ha di oliveti, con danni incalcolabili. Anche in Argentina dal dicembre 2013 in due diverse aree, sono stati rilevati sintomi analoghi a quelli degli olivi italiani e da queste piante è stato isolato il medesimo batterio, X. fastidiosa subsp.pauca.
Il presente Progetto si propone di mettere a punto due tecniche di indagine molecolare capaci di analizzare in dettaglio similarità e le divergenze tra gli isolati italiani e quelli argentini. La prima tecnica è il MultiLocus Sequence Typing (MLST) che si basa sulla analisi delle sequenze di alcuni geni specifici, tra loro concatenate ad ottenere una unica sequenza infine utilizzata per una analisi filogenetica. Essa è stata già applicata a X. fastidiosa con un numero di geni limitato, ma nel presente progetto si intende allargarla ad un maggior numero di geni scelti in maniera appropriata per rendere l'analisi più dettagliata ed affidabile.
La seconda metodica è l'MLVA (Multiple Loci Variable number of tandem repeats Analysis) che analizza il polimorfismo di sequenze di DNA ripetute in tandem (TRs). Questo è un metodo molto sensibile e robusto per la genotipizzazione di microrganismi che ha l’enorme vantaggio di essere veloce, affidabile, e facilmente ripetibile in laboratori diversi. Il principale risultato atteso, in termini tecnico-scientifici, di questo progetto è quindi la messa a punto di questi due importanti strumenti diagnostici molecolari, la cui applicazione avrà notevole impatto sulla comprensione delle dinamiche e delle vie preferenziali di diffusione del patogeno, sulle similarità e differenze tra la situazione italiana e quella argentina, e sul rafforzamento delle misure di prevenzione e contenimento della diffusione della malattia.