Il DAFNE partecipa inoltre alla gestione e funzionamento di alcune struture comuni del Sistema Museale di Ateneo (SMA), le quali hanno uno specifico responsabile nominato dall'Ateneo. Le principali strutture sono di seguito riportate:

• Azienda Agraria Didattico Sperimentale "N. Lupori" - Direttore Prof. Giuseppe Colla
• CIRDER - Centro Interdipartimentale di Ricerca e Diffusione delle Energie Rinnovabili - Presidente Prof. Maurizio Carlini
• Centro Interdipartimentale dell'Orto Botanico dell'Università della Tuscia - Direttore Prof. Giuseppe Colla
• Museo Erbario della Tuscia - Responsabile scientifico Prof.ssa Anna Scoppola
• Banca del Germoplasma della Tuscia - Responsabile Dott.ssa Sara Magrini
• Collezione entomologica della Tuscia - Responsabile Prof.ssa Adalgisa Guglielmino
• Centro Grandi Attrezzature di Ateneo - Componente del Comitato Scientifico per il DAFNE: Prof.ssa Roberta Bernini
• Polo Bibliotecario Tecnico-Scientifico - Direttore Dott.ssa Laura Tavoloni
• Collezioni della ex Facoltà di Agraria 

Responsabile:  Prof. Nicola Lacetera    nicgio@unitus.it